虽然名字被牵涉在“马哈迪计划”（Project M，亦称身份证计划）内，但是前首相马哈迪指该计划与他无关，同时否认巫统曾经暗中发出身份证，让成千上万名非法进入沙巴的移民成为合格选民。
尽管如此，马哈迪揭露，确实有一些人涉及“马哈迪计划”。
在不停追问是否对上述派假身份证制造选民知情时，马哈迪仅回覆说，“不，不是我”。
在位于布城的首要领导基金会办公室接受专访时，马哈迪受到《当今大马》编辑们连环式围绕着“马哈迪计划”追问，但是他仍然大耍太极，逃避做出正面回应。
他以一贯的嘲讽口吻回应说，“有一个M字母真好。曾经，我们也拥有一个双M（马哈迪和前副首相慕沙希淡）领导的政府”。
沙巴的外来人口主要以菲律宾穆斯林为主，其人数高达175万，高达60万名非法移民获得身份证，而本地人口却只有150万。据说在一些县，外来人口大大高于本地人口，高达70％。
目前尚无法确定是否存在的“马哈迪计划”，是指一项涉及政府部门的秘密计划。在该计划下，成千上万名非法进入沙巴的移民获得当局发出身份证，让他们成为合格选民。有一名菲律宾籍男子早前曾经公开承认在上述计划下获得身份证。
根据报道，当时的副内政部长美格朱聂曾在吉隆坡主持一项机密会议，出席者包括移民局、国民登记局高官，以及当时的政府首席秘书阿未沙基，当时阿未沙基极力反对签发大马身份证给非法移民的建议，但却被告知当时的首相马哈迪已经批准这项计划，因此被称为“马哈迪计划”。
马哈迪在自称无辜的同时，也反指一些沙巴人可能涉及发假身份证予外来者，以成为合法选民投选巫统。不过，他坚称其幕后黑手并非巫统或政府。
“当然不是。可能是一些有利益关系者这么做，可能为了钱。”
承诺不过滤互联网违背意愿
此外，针对在位时曾经承诺不会过滤互联网，马哈迪表示，这个承诺其实是违背了他本身的意愿。
他说，他是逼不得已之下，才答应多媒体超级走廊国际顾问团的要求，以获得外国投资者的协助发展有关计划。
“就算在当时候，我是想要过滤互联网的，因为我认为互联网破坏道德价值。”
“当时候，情况还没有那么严重。但是现在，却真的非常严重。”
不过，马哈迪也迅速的补充说，他所要过滤的互联网内容，并非针对“异见”。
“我不是要过滤不同的意见。有异见是没有问题的，我是要过滤那些不健康和淫秽的内容。”
否认宣布回教国是宗教纠纷导因
马哈迪也坚称，最近国内发生一连串的宗教纠纷导致国内气氛紧张，与他於2001年9月宣布马来西亚为回教国无关。
相反的，他认为，穆斯林与非穆斯林的紧张关系，是源自宗教局对宗教信仰的错误诠释，因为执法者没有遵守回教的真正教义。
“这个日益紧张的情况，与回教国没有关系。这是因为你没有向对方好好解释。因为诠释错误，这变成了一个问题。翻回可兰经，看看回教如何教导你在这类案件上，应该怎么做。”
马哈迪也不认同，基于宗教原因，可兰经教导信徒强硬把夫妻和孩子拆散。
【点击此处观看专访短片】
以下是马哈迪独家专访的精粹：
《当今大马》：砂拉越首席部长泰益玛目被指涉及一些伐木的贿案。你对泰益的认识匪浅，你觉得他有什么事？
马哈迪：我想，华社（砂拉越）看来已经幻想破灭。因此，在上次州选举时，他们没有投选人联党。但是，马来人看来还是满于现状。
目前是否巫统进军砂拉越的时机？
我不认为它应该进入砂拉越和骚扰当地。我们当时是因为局势紧急才进入沙巴的。在1990年大选，拜林吉丁岸（Pairin Kitingan）退出国阵，因此我必须去沙巴。但是在砂拉越，我觉得应该由首相决定是否要进入砂拉越。
进入砂拉越是否一个理想的决定？
我不知道。
但是有传言指巫统正在砂拉越设立筹委会。
（前首相署部长和前国防部长）阿邦阿布巴卡曾经希望巫统进军当地。但是我不想干扰砂拉越的局势。当时，《日本时报》没有报道任何事情，《当今大马》也还没有成立。
泰益掌权也相当久了。你觉得他是否应该下台了？
这应该由他本身决定。我一直确信，每个人都不应该在位太久，如果你掌权太久，人民可能会不喜欢你。
有一些指控说，在沙巴有人派假身份证号给外来者，以便投选巫统。
这在沙巴是有可能发生的。那里的人可以做出任何事情。当沙巴州开始获得民主时，国阵一直以来都取得100%的胜利，因为任何人若要对垒联盟（国阵的前身），都无法去到官员的登记处。在他们抵达前，都会发生一些事情。
有人指责巫统发身份证给外来者，以便......
不是巫统。可能有一些人这么做，但不是巫统。
政府呢？
肯定不是政府。可能是一些有利益关系者这么做，可能为了钱。
有人指美格朱聂和警方曾出席一个特别会议，当时讨论了这些东西。你对这个“M计划”是否知情？
不。不是我。
那么，“M计划”不是“马哈迪计划”？
有一个M字母真好。曾经，我们也拥有一个双M（马哈迪和前副首相慕沙希淡）领导的政府。
人民不满数理科媒介语从马来文转变成英文。你目前是否仍觉得这是一个好的决定。
我仍然坚信，如果我们要进步，如果马来人要进步，他们必须掌握英文，而他们必须以英文学习数理科。我不想看到任何马来人对英文毫无掌握能力，以及在科学方面没有进步。我们可以学习初级的科学，例如氧气和氢气；但是，当你要进入更高级的科学，当你要赢取诺贝尔奖......
但是，我们修读科学系的学生不多，大部分进入文科。所以，强迫他们有何用处？大家在谈论，过去4年来的及格率，反映出有关政策不是那么成功。当中有一些东西出错了，无论是政策本身或执行方面。
如果你决心要做，你将会做到。以英文教授科学并不难，尤其是现在有各种辅助软件。今天要学英文是非常容易的。教师可能无法说英语，但是他可以用软件，并且和学生一起学习。
我曾尝试学习法文，虽然我无法说得流利，但是他们现在有许多软件可以迅速教导你。在两三个月内，你应该就会上手。儿童学习能力很快，他们可以迅速学会英文。
但是，还有一些学校的电脑仍然破旧，而政府不愿或甚至没有能力更换它们。
这是行政问题，不是政府的政策。电脑坏了，若你想要更替电脑，总会有法子的，除非你不想要更替，那么肯定就没有钱啦。就如弯桥事件，你说你没有钱，但是现在却浪费了14亿令吉建造关税局和移民厅综合中心大厦。
你几年前宣布马来西亚是回教国，而目前国内的宗教紧张局势日益升温，你觉得与回教国的宣布有关吗？
这个日益紧张的情况，与回教国没有关系。这是因为你没有向对方好好解释。在我执政期间，我反对回教法，不是因为我反对宗教法律，而是我反对他们对回教法律的诠释，因为他们并非根据回教教义去诠释。
现在的情况是，母亲被迫与孩子分开，以及夫妻被拆散，你有何解决方法？
因为诠释错误，这变成了一个问题。翻回可兰经，看看回教如何教导你在这类案件上，应该怎么做。
你是否认同宗教局的做法？强硬分开苏巴斯妮和她的孩子？
这是否可兰经的教义吗？我不这么认为。
你不这么认为？
我不这么认为。问题是，非穆斯林难以讨论或质疑此事。我们生活在恐惧的气氛下，因此很难挺身出来辩论......
那么，你承认我们是生活在恐惧的气氛下？之前，我们没有这个问题。但是，现在变得越来越严重。这都是从你宣布回教国开始。
不是，回教国只是回教国。
但是，大部分问题都是从你宣布后开始......
回教国有很多，不过，究竟什么是回教国的定义呢？
根据你的说法，它是一个由穆斯林占多数及管理的国家。因此，虽然我们是世俗国，但是我们依然是回教国。这是你的诠释。但是在基层，我们发现......
这些事情需交由政府去解决。
我们有回教文明（Islam Hadhari）来解决......
我不知道什么是回教文明。我不是回教文明的穆斯林。我是穆斯林。句号。
你觉得，你对马来西亚政坛仍然举足轻重？
我已经无关紧要了，我已经退休了。
那么，你对于本身的退休生活觉得满意？
我已经退休，但还是会时不时开口......向《当今大马》发言。
最后一个问题，针对互联网。你决定不要过滤互联网，这是一件好事，但是这并不像你一贯的风格。
我是被迫说“我不会过滤互联网”的。
你是被迫这么说的？
是的。多媒体超级走廊国际顾问团告诉我，不可以过滤互联网。就算在当时候，我是想要过滤互联网的，因为我认为互联网破坏道德价值。
那么，为何你决定不要过滤互联网？
因为我必须满足这些人，否则他们会说，马来西亚不是一个自由的国家。当时的情况不是那么严重。但是现在却真的非常严重。
你事后觉得，这是否一个正确的决定？
我想，在当时我是被迫的。有时候，你受到外资的压力时，我们需要他们的合作，因为我们要发展多媒体超级走廊，当这些具有强大影响力的人说，“别过滤互联网”，而我只好说，“既然你这么说，好的”。
但是，我从来都不曾认同，就算现在也不认同。不过，我不是要过滤不同的意见。有异见是没有问题的，我是要过滤那些不健康和淫秽的内容。
你是否有想过要设立本身的部落格？
有人向我建议过，但是我没有时间。我必须依赖你们。
你是否想要在《当今大马》设立专栏？
专栏就不要了，偶尔的访问就好。