《独立新闻在线》于2005年8月9日开通、8月31日正式推介，与《当今大马》中文版一起掀开独立网络媒体之风潮，走过了七年风雨路。创刊后的六年里，《独立新闻在线》一直是由饶仁毅先生负责筹集经费维持网站的经营，并以“取之社会，用之社会”的精神让广大读者群免费近用资讯，期许促进多元舆论与资讯自由流通。
2011年5月，《独立新闻在线》遭逢停刊危机，同事们展开自救运动；尔后与《当今大马》联合推出订阅计划，尝试辟出一条生路。广大读者群的鼎力支持，从捐赠到订阅，令《独立新闻在线》免于仓促熄灯。
然而，媒体是人力密集的事业。广大读者群的支持固然帮助《独立新闻在线》撑过了停刊危机，但是一年多来，《独立新闻在线》虽然努力地开源节流，将每个月六万余元的开销降低到五万余元，并且连月奔走寻找投资者和赞助人，但是经过一年的尝试，仍没法找到合适的投资者和愿意慷慨解囊的赞助人；读者的捐款仅能应付四个月的开销，后来的订阅费仅能承担我们一半的开销，《独立新闻在线》过去半年都是在“先用未来钱”的状态下度日。
经费困顿既导致《独立新闻在线》未能恢复原有的幅员规模，亦未能吸引新血加盟。这种情况导致《独立新闻在线》同时承受经费困顿与人力短缺的煎熬，编采团队主要人员既困于繁重的日常新闻编采作业，又得疲于奔命地张罗经费。长期而言，《独立新闻在线》恐无法继续坚持素来获肯定的新闻分析与调查报道之方针，亦不易维持原有对高品质新闻之要求，更看不到足以稳健前进之希望。
为免《独立新闻在线》成为网络新闻业与社会资源之负担，董事会决定在创刊七周年之际为《独立新闻在线》划下句点，自2012年8月31日起无限期停刊。
停刊之后，《独立新闻在线》希望继续秉持“取之社会，用之社会”的精神，若能力所及，将让网站继续保持开放，作为公众乃至学者免费检索新闻史料的研究资源，藉此延续《独立新闻在线》之精神。
读者订阅费处理方式
由于《独立新闻在线》自2011年10月开始，与《当今大马》中文版推出联合订阅计划，随着《独立新闻在线》将在8月31日停刊，就既有订户已交付之订阅费部分，我们研拟下列两个方案：
欲处理退款或继续订阅事宜的读者，可以联络热线电话：016-6419177和03-7783 9916，或电邮：[email protected]
方案（一）：转移订阅《当今大马》英文版
《独立新闻在线》未期满之订阅期限，转移至订阅《当今大马》英文版作为赔偿，订阅者可同时阅读《当今大马》中文版及英文版新闻。
另一方面，为了回馈读者支持，所有订阅期限剩下一年或以上的读者可以获得《独立新闻在线》、《当今大马》及策略资讯研究中心即将出版的新书---《老板上街了：428黄绿大集会记事》（右图）。该书预计在8月下旬正式出版，届时将会通知读者索取。
此书收录了428净选盟大集会的新闻报道、评论文章、图片及读者现场亲历描绘。这本厚达240页，定价马币28元的新书乃《共赴709 Bersih 2.0实录：我们用脚写历史》的下集。
由于分摊所得的《428黄绿大集会记事》新书数量有限，仅有800本，因此被迫采纳先到先得方式分派。我们欢迎读者上门索取，或在《当今大马》往后全国主办活动时索取；至于想要透过邮寄方式获得新书的订户，希望能够念及两家网络媒体已经自行负担出版及编辑费用，恳请自付10元邮费。
想要获得赠书读者，请填妥 表格 后即可。
我们鼓励读者采纳第一个方案，因为此举等同将订阅费余额捐赠《独立新闻在线》。《独立新闻在线》仍需要一笔为数不小的经费，作为处理停刊善后之开支，包括清还债务、办公室水电开销、员工薪资等。虽然《独立新闻在线》过去半年都是仰赖读者预付的订阅费维生，实际上它还需向社会贤达募款，以退还估计高达马币25万元的余额。故而，谨此恳请读者念兹《独立新闻在线》作为独立媒体的特殊性质，以及创刊首六年作为免费近用的公共媒体之旧情，慷慨捐赠余额。
至于拥有双重《当今大马》英文版及中文版户口的读者，《当今大马》献意根据订阅费用进行延长，并按例处理，保证根据合理及公平原则落实。任何涉及《当今大马》户口事项读者，可请联络电话：03-22843367（注明中文订阅），或电邮：[email protected]。
方案（二）：退款方式
根据按比例计算（pro rata）原则，索回订费余额。计算方法为：已付订费乘以订阅期限所剩余月数之比例。例如：读者甲支付RM150订阅普通配套一年（12个月），而订阅期限仅剩3个月，其可索回之退款为：
RM150 X （3 ÷ 12）= RM37.50。
《当今大马》及《独立新闻在线》将在近期内根据订户订阅时登记之电子邮箱发出电邮，通知订户回复捐赠或索回订阅费之意愿，希冀订户尽早回复，以利善后作业。
《独立新闻在线》及《当今大马》获得读者踊跃响应联合订阅计划，所有同仁皆感激各方呵护与支持。此次《独立新闻在线》忍痛宣布无限期停刊，及双方被迫中止联合订阅计划，凸显在威权的国度里头经营独立媒体之艰苦，一切尙祈读者包涵谅解。然而我们深信独立媒体的理想永不灭，坚信寒冬过后，春天势必到来！
漆黑得隧道终会凿穿，
千仞的高岗必被爬上，
当百花凋谢的日子，
我将回来开放。
我将归来开放 ―― 李敖（1957年7月29日）